Kalsnavas pamatskola īsteno šādas mācību programmas:

• Vispārējās pirmsskolas izglītības programma (kods – 01011111);

• Pamatizglītības programma (kods – 21011111);

• Speciālās pamatizglītības programma izglītojamajiem ar mācīšanās traucējumiem (kods – 21015611)